在對倒置顯微鏡的樣品的觀察準備，必須把樣品在培養箱內取出一些在壁上存在的活細胞中，可以把倒置顯微鏡可以在邊上待觀察。
需要把此顯微鏡的電源開關給打開，需要將低倍物鏡所轉到工作進行時才可以，需要把視野給調整到光線最強度的狀態才可以。
在倒置顯微鏡的瓶中會需要把東西放在載物臺上固定好。需要把調螺旋把焦距給調好，然后把標本進行轉動然后將培養器內的存活細胞給看一遍。擇優選擇才可以采用高倍鏡來作細胞來觀察，必須可以利用顯微鏡的裝置來進行攝影與生長狀態的記錄。
在進行相對觀察和照相后，需要把細胞培養瓶內。然后需要把電源關閉后把顯微鏡進行防塵。
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